有個名偵探，名叫柯南，他果斷勇敢，破案無數。

有一天，有一位神秘人邀請毛利一家去航空母艦上玩，但如果他們走了，柯南就沒人照顧了，征得神秘人同意后，柯南也跟著毛利一家走上母艦。

剛剛走上母艦，柯南還不適應迎面吹來的風，就來到了船尾。這時，竊竊私語的聲音傳進了柯南的耳朵。是誰在笑聲說話?難道是神秘人?懷著不解的心情，柯南小心翼翼地走到他們身邊藏了起來。“這次計劃有把握嗎?只準成功，不準失敗。”其中一個人說。另一個人說“放心吧，老大。只要我出馬，這艦上所有的人，都會被我……哼哼。”他又做了一個抹脖子的動作。柯南看見了這一切，心想：不好!難道他們要殺死所有人?不行，我一定要阻止他們!于是柯南開始跟蹤他們。

他們在母艦上繞了大半天，來到了一個隱形的密碼門前，飛快地按下了密碼，走了進去。柯南趕緊沖上去，可門已經關了起來。柯南在四周走了一圈，并沒有窗戶，怎么辦呢?柯南想了一會，“我知道了，可以從指紋入手”，柯南興奮得跳了起來。于是他仔細觀察起來，過了幾分鐘，柯南破解了密碼，走了進去，四處張望，尋找可疑人物。這時，一個人影飄到了柯南身后，舉起棍子，想要襲擊柯南。他哪里知道，柯南早就發現了他并做好了準備。說時遲，那時快，就在棍子打中柯南的瞬間，柯南使勁往前一跳，在空中轉過身體，打開***，迅速瞄準，發射了一枚麻醉彈，那人影還沒有反應過來就倒在了地上。柯南費力地拖著被麻醉的人告訴了艦長。在逼供下，那個壞人告訴了另一個人的位置，還說他們在艦上安了十枚炸彈，想把艦上所有的人都通通消滅掉。柯南得知后，立刻根據壞人提供的信息，抓到了他的同伙。

就這樣，柯南用他的聰明才智，拯救了艦上的所有人。